1、第004话 大都会暗号地图事件：柯南和伙伴们去美术馆时捡到了一张画有奇怪符号的纸，大家自行成立少年侦探团去调查这些暗号，按照符号的指示先到达东京塔，在周围展开侦查却一无所获，休息的时候步美的新发现为柯南找到破解暗号的出口，大家一路寻找从东京铁塔到南部水族馆的标记。
2、第013话 步美被绑架了：柯南和步美他们一起玩捉迷藏的游戏，步美躲在一辆车的后车厢中，没想到竟然睡着。元太一直都找不到步美，最后柯南终于用无线电和她联络上了步美，但步美却在车的后备箱中发现了一个人头！刚好此时有件连续绑架少女杀人事件，柯南怀疑那辆车的两个男人就是那个事件的歹徒。为了救出步美柯南通过步美的描述利用滑板开始追踪步美。最终柯南成功追上了步美但所谓的连续杀人犯却是误会一场。
3、第136话 黑暗组织来的女子：柯南的班级转来了一个叫灰原哀的女生，而同一天少年侦探队也收到了同校俊野帮忙找哥哥的委托，大家一起去俊野家进行调查，发现了一张夏目漱石的肖像画，俊野说曾有一个黑衣女人很赏识这幅画，听到这些，柯南马上联想到了黑衣组织，便急忙带领侦探队走街串巷的寻找线索。期间，在便利店遇到的一个使用假钱的男子引起他的注意，于是，一路尾随，推理出了这名男子的去向。
4、第203话 生死一瞬间、侦探队洞窟探险：少年侦探队本来是跟着阿笠博士一起出来露营，没想到居然在森林中发现了一个钟乳石洞穴，柯南四人立刻进洞探险，却在这里碰到了一伙儿搬运尸体的歹徒，而柯南为了掩护大家逃跑中弹受伤，之后，便血流不止，元太背着柯南寻找出口，可身后的歹徒也循着声音疾步追来。
5、第474话 侦探团特别专访(下集)：警方听过答录机里的留言后，分别向留言的蓬田、桧垣和稻叶打电话确认，发现每个人都有不在场证明，虽然警察没有头绪，但柯南却早已知道凶手是谁，可介于小林老师的暗中观察，柯南不能表现的太过明显。于是，他将自己的推理简单告诉元太他们，让他们分担必要的说辞，提醒警察逐一排除其他两名嫌疑人犯案的可能，那么，最有可能犯案的就是他！
