1、水分。作为生命活动的物质基础存在。培养基的绝大部分物质为水分。实验研究中常用的水为蒸馏水，而最理想的水应该为纯水，即二次蒸馏的水。生产上，为了降低成本，我们可以用高质量的自来水或软水来代替。
2、无机盐类。植物在培养基中可以吸收的大量元素和微量元素都是来自于培养基中的无机盐。培养基中提供的无机盐主要有硝酸铵、硝酸钾、硫酸铵、氯化钙、硫酸镁、磷酸二氢钾、磷酸二氢钠等，不同的培养基配方当中其含量各不相同。
3、有机营养成分。包括糖类物质，主要用于提供碳源和能源，常见的有蔗糖、葡萄糖、麦芽糖、果糖；维生素类物质，主要用于植物组织的生长和分化，常用的维生素有盐酸硫胺素、盐酸吡哆醇、烟酸、生物素等；氨基酸类物质，常见的有甘氨酸、丝氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺等，有助于外植体的生长以及不定芽、不定胚的分化促进。
4、植物生长调节物质。植物生长调节物质在培养基中的用量很小，但是其作用很大。它不仅可以促进植物组织的脱分化和形成愈伤组织，还可以诱导不定芽、不定胚的形成。最常用的有生长素和细胞分裂素，有时也会用到赤霉素和脱落酸。
5、天然有机添加物质。香蕉汁、椰子汁、土豆泥等天然有机添加物质，有时会有良好的效果。但是这些物质的重复性差，还会因高压灭菌而变性，从而失去效果。
6、凝固剂。要进行固体培养，要在培养基中加入凝固剂。常见的有琼脂和卡拉胶，用量一般在7～10克/升之间。前者生产中常用，后者透明度高，但价格贵。
7、其他添加物。有时为了减少外植体的褐变，需要向培养基中加入一些防褐变物质，如活性炭、维生素C等。还可以添加一些抗生素物质，以此来抑制杂菌的生长。
8、pH。培养基的pH也是影响植物组织培养成败的因素之一。pH的高低应根据所培养的植物种类来确定，pH过高或过低，培养基会变硬或变软。生产上或实验中，常用氢氧化钠或盐酸进行调节。
