执行补偿贸易合同的经营单位和生产企业，应于合同批准之日起1个月内向海关申请备案登记，同时提交下列单证：
1.经贸主管部门签发的批准书和合同备案证明书。
2.工商行政管理部门颁发的营业执照。
3.对外签订的合同副本。
4.对外经贸主管部门批准立项的应领出口货物许可证的出口成品批件。
5.海关认为必要的其他单证和经济担保。
海关在对上述单证审核后，对符合补偿贸易条件予以备案，并核发《加工装配和中小型补偿贸易进口货物登记手册》，凭以办理货物的报关手续。
办理报关员注册手续
参加报关员资格全国统一考试成绩合格，取得《报关员资格证书》者，方可申请报关员注册。
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办理出口收汇核销手续
出口单位在向当地外汇管理部门办理核销时，如报关单金额和收汇金额差额，须提供有关证明。
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减免税备案手续
项目单位申请办理减免税备案手续时，应当填写《减免税备案申请表》，并向海关提交齐全有效的备案单证。
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预验商品办理出口换证手续
出口商品检验换证凭单已超过检验有效期，或证单上的商品标记与出口商品包装上的标记不符，以及批次错乱、数量不符时，不得申请出口换证，应另行重新报出口检验。
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来料加工海关核销手续
海关为简化手续，提高工作效率，体现促进与服务生产的方针，根据不同的企业和商品分别采取信任核销、一般核销和重点核销等方法进行核销：
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办理出口退税报关手续
出口货物退税企业应在其出口货物装载的运输工具办结海关手续后，报关员向其报关的海关申请办理出口货物的退税专用报关单(浅黄色)。
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报关单“二次核对”手续
对进口付汇金额在50万美元及以上的或联网电子数据不能查核的有疑问的报关单，银行、外管、税务等部门可指定专人或发函（特快专递）送报关单到签发地海关或监管处进行“二次核对”。
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